В оргструктуре нового шторма изменён принцип подчиненности - в него добавлены группы, отождествляющие структурные подразделения компании (департаменты, отделы, службы, участки и т.п.).
Если ранее, в старом (красном) шторме у вас уже была создана оргструктура, то она отобразится в новом шторме. Но она не будет правильно работать в новом шторме из-за отсутствия групп в иерархическом дереве подчинённости. Чтобы это изменить и оргструктура работала корректно, необходимо добавить группы в ветки подчинённости.

Видео с примером такого преобразования -
https://youtu.be/wmuzux6UFuM

Если видео недоступно, то его можно посмотреть, открыв дубль в ВК-видео:
https://vkvideo.ru/video-227313390_456239223